循环肿瘤DNA是什么意思?
循环肿瘤DNA:通常意味着什么,不能证明什么,以及接下来该问什么。
循环肿瘤DNA是一种需要上下文的报告语言。在液体活组织检查、分子检测、临床试验和监测报告中,这意味着在血液或其他体液中寻找肿瘤DNA的小片段。本页解释了通俗语言的含义、限制、可能的后续问题,以及为何您的医疗团队必须将其与其他结果一起解释。
管子里到底装的是什么
每个人的血液中都含有游离DNA,简称cfDNA。这些是细胞死亡后漂浮在血浆中的短小断裂DNA片段,并泄漏了内容物。在癌症患者中,其中一些片段来自肿瘤细胞。这部分是循环肿瘤DNA,简称ctDNA。
FDA 将其定义为肿瘤来源的碎片DNA,脱落到血液中,且未连接到任何细胞。同样的指导对此也明确了。ctDNA的存在量因肿瘤类型和位置而异。它还因分期、肿瘤数量以及癌症反应方式而异。
这种变异性正是为什么这些检测在同一周既强大又不可靠的原因。
报告背后的测量
ctDNA检测不仅仅是单一检测,但 FDA 批准的肺癌检测Guardant360 CDx显示了所涉及的量表。
它至少需要5毫升全血。血液进入一个特殊的管子,防止白细胞破裂,导致正常DNA充斥样本。检测结果会读取这些DNA。它会观察55基因的单字母变化、2基因的多余拷贝,以及4基因的融合。
其公开的检测极限是0.2%到1.5%的突变等位基因分数。哪一端适用取决于实验室能回收多少DNA。突变等位基因分数,也称为变异等位基因频率,是指该点携带变化的DNA片段的比例。在0.2%时,检测是在一千个变异片段中寻找两个。
如果你的报告列出了一个变异,旁边有百分比,那百分比就是这个数字。非常低的比例并不一定不那么严重,但更接近检测能看到的边缘。
陷阱是阴性结果
这是批准文件中最重要的一句话,值得引用:“血浆样本的阴性结果并不保证患者的肿瘤基因组检测结果为阴性。”
FDA 的指示就是基于此而来。肺癌患者如果血浆上列出的生物标志物检测为阴性,应被反复进行组织活组织检查。
肿瘤可能几乎不向血液中添加任何物质。这发生在肿瘤较小、脱落缓慢或位于血脑屏障后方时。因此,阴性血液检测意味着检测未发现它。也不意味着它不存在。阳性结果比阴性结果更有信息量。
测试被要求做什么
三种不同的工作被归入同一个短语,它们所携带的证据层次也不同。
现在正在选择药物。 这是既定的使用方式。几种血浆检测是 FDA 批准的辅助诊断。这意味着该机构批准它们为某一种指定药物挑选患者。
**发现分子残留病变。**MRD指的是手术、放疗或化疗后仍存在的ctDNA,目的是清除癌症。发现它意味着疾病依然存在,即使扫描结果看起来很干净。
**追踪反应随时间变化。**观察ctDNA在治疗期间的上升或下降正在研究中,作为早期信号。FDA 明确表示,首先需要更多随机试验的数据。在此之前,ctDNA的变化不是被接受的试验终点。
哪些等离子检测是 FDA 批准的,具体原因是什么
FDA 维护一份公开的已批准伴随诊断清单。该名单上显示了三项基于血浆的检测。
Guardant360 CDx涵盖四种EGFR变化:外显子19缺失、L858R21外显子、T790M和外显子20插入。还涵盖KRAS G12C、两次ERBB2变化和ESR1错义变化。其配药包括奥西替尼、阿米凡他抗、索托拉西布、fam-曲妥珠单抗deruxtecan和elacestrant。
FoundationOne 液体CDx涵盖更广泛的范围。包括EGFR、BRAF V600E、MET外显子14跳跃,以及ROS1、NTRK和ALK基因变化。它还涵盖了PIK3CA的固定变化以及BRCA1和BRCA2的变化。其药物包括吉非替尼、奥斯默替尼、厄洛替尼、恩科拉芬尼与比尼美替尼、鲁卡帕替尼、卡普替尼、恩曲替尼、阿勒替尼和阿佩利西布。
cobas EGFR突变测试v2涵盖EGFR外显子19缺失、L858R和T790M,配合奥斯默替尼和厄洛替尼。
注意这份清单没有什么。这些都没有被批准告诉你是否患有癌症。也没有任何一项被批准决定手术后是否接受化疗。批准与下令之间的差距值得关注。
肿瘤知情与肿瘤新检测
FDA 的指导将ctDNA检测分为两种设计,差异会体现在你的结果中。
肿瘤知情的检测会先读取你的实际肿瘤。它会选择一组个人变化,然后只在血液中搜索。它的回报是精准度,因为发现的任何变化都已被证明存在于你的肿瘤中。弱点是它无法看到后来出现的变化。这包括那些驱动药物耐药性的变化。
未检测肿瘤检测使用固定基因面板,无需事先检查肿瘤。它更快,因为不需要先读取任何信息。但可能不包括对你情况重要的基因。
如果有人告诉你ctDNA检测是阴性,问问是哪种类型。这两种测试的失败方式不同。其中一种可能从未包含该基因。另一种可能错过了极低水平存在的变化。
阅读MRD结果而不过度解读
对于MRD的使用,FDA 设定了两个不同的标准。在阴性结果下减少治疗需要高敏感度和高阴性预测值。对阳性结果加药则需要高特异性和高阳性预测值。
这个差距才是实际问题所在。用ctDNA添加治疗,和用ctDNA阻碍治疗是不一样的。一种检测对其中一种检测有效,而另一种可能不行。
指导还强调稳定的时机和处理。抽血时间和处理方式都会改变答案。
值得对自己结果提出的问题
- 具体做了哪些检查,按名称,以及是肿瘤知情还是肿瘤新手
- 该检测是否获得 FDA 批准,还是用于非适应症用途
- 每个变异体报告的突变等位基因分数是多少
- 如果是阴性,下一步是组织检测吗
- 基于该结果的决策发生变化,以及错误会发生什么
- 何时重抽才有意义