下一代测序报告揭示了什么
测序报告会列出癌细胞中发现的基因和蛋白质变化,并标记已知治疗针对的任何变化。以下是如何阅读这些报告而不迷失的方法。
测序会读取癌细胞的遗传密码,并将其与健康细胞进行比较。实验室随后会生成一份报告,列出发现的生物标志物以及是否有适合你的治疗方法。这类报告中的大多数条目不会改变你的治疗。
首先,排序的内容
测序就是逐字母读取遗传密码。在癌症上测序时,重点是找出这些细胞的不同之处。
National Cancer Institute描述了该检测所属的一系列检测:生物标志物检测是一种寻找基因、蛋白质及其他物质——称为生物标志物或肿瘤标记物——以提供癌症信息的方法。
你会看到它有很多不同的称呼。NCI 列出了肿瘤检测、肿瘤基因检测、基因组检测、基因组分析、分子检测、分子分析、体细胞检测和肿瘤亚型分类。它们有很大重叠。如果你的团队使用了你不认识的术语,问问他们指的是哪一个。
测序报告是对你癌症结构的描述,而不是对你预后的看法。
测试看起来有多远
面板范围各异。NCI 提到两种最广泛的方法:全外显子测序检查癌症中的所有基因,而全基因组测序分析所有DNA,包括基因及其间区域。
许多报告来自覆盖定义基因列表的更窄面板。范围越广并不意味着一定更好——重要的是检测是否覆盖了与你癌症类型相关的变化。这是合理的问题。
肿瘤与健康组织的比较
这里是让人困惑的部分。NCI 解释说,这些检测是比较你的癌细胞和健康细胞,以发现在你一生中出现的基因变化,称为体细胞突变。
这种比较区分了“这是癌症的变化”和“这只是你的DNA读取方式”。没有它,普通人类的变异看起来就像肿瘤生物学。
NCI 明确指出,这与遗传风险检测是不同的:检测生物标志物不同于用于判断某人是否遗传突变、使其更易患癌的基因检测。如果在检测过程中发现遗传突变,NCI 说你可能需要再次进行基因检测来确认自己是否真的有遗传突变。
报告内容
NCI 直接表达结果:实验室会制作一份报告,列出你癌细胞中的生物标志物,以及是否有适合你的治疗方法。
所以一份典型的报告有两层。一是发现了什么的原始列表。另一是解释——这些发现中哪些与某种疗法相关联。
列表中的发现并不自动有用。NCI 指出,被认为无害的基因变化称为良性,或其影响未知的变异,称为未知意义的变异,不被用于治疗决策。
这句话能帮你省去数小时的担忧。测序报告中的大多数行是噪声。少数是信号。你的肿瘤科医生的工作是告诉你哪些是哪种。
当有用的东西出现时会发生什么
NCI 描述了回报:生物标志物检测结果可能显示你的癌症具有某种已知疗法靶向的生物标志物。
这可能意味着某种特定的药物。也可能意味着是否符合临床试验的资格。这可能确认已经计划好的治疗方案是正确的。这三种都算作测试完成了它的任务。
如果报告回来时没有任何可采取的依据
这是一个常见且令人失望的结果。这并不意味着测试被浪费,也不意味着什么都做不了——而是这条路没有打开一扇门。
那时实际需要做的事情:
- 询问所用的面板是否涵盖了与你癌症类型相关的所有内容。
- 询问是否有足够的组织完成整个面板,因为不完整检测和阴性检测不是同一回事。
- 询问试验情况,有时会接受非特定生物标志物的申请。
- 问问以后用新组织重复检测是否值得。
测序确实改变了癌症护理的可能性。但它并没有改变所有人的情况,坦诚地告诉他们总比被遗弃去猜测要好。